استفاده بی‌رویه یا نادرست از آنتی‌بیوتیک‌ها در دام می‌تواند باعث بروز عوارض گوارشی از جمله اسهال آنتی‌بیوتیکی شود. این عارضه نه تنها بر سلامت حیوان بلکه بر رشد، تولید و سودآوری دامداری تأثیر منفی دارد.
گونه هدف نئومایسین باکتری‌های گرم منفی هوازی مانند اشریشیاکلای، سالمونلا، پروتئوس و کلبسیلا و برخی از باکتری‌های گرم مثبت هوازی می‌باشند. این دارو جهت درمان آنتریت و اسهال دام و طیور ناشی از باکتری‌های گرم منفی هوازی تجویز می‌شود.